SMP Negeri 50 Surabaya menyediakan fasilitas kamar mandi yang bersih, nyaman, dan mudah diakses untuk mendukung kenyamanan seluruh peserta didik selama berada di lingkungan sekolah. Kebersihan kamar mandi menjadi salah satu prioritas sekolah sebagai bagian dari upaya menciptakan lingkungan belajar yang sehat dan kondusif.
Untuk memenuhi kebutuhan siswa, setiap area kelas dilengkapi dengan kamar mandi untuk setiap kelas, yaitu satu kamar mandi untuk siswa laki-laki dan satu kamar mandi untuk siswa perempuan. Pemisahan fasilitas ini memberikan kenyamanan, keamanan, serta menjaga privasi peserta didik dalam penggunaannya.
Sekolah juga membiasakan seluruh warga sekolah untuk menjaga kebersihan kamar mandi melalui budaya hidup bersih dan sehat. Dengan tersedianya fasilitas yang memadai serta pengelolaan yang baik, kamar mandi di SMP Negeri 50 Surabaya diharapkan dapat mendukung kesehatan, kenyamanan, dan kelancaran aktivitas belajar mengajar setiap hari.